Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms