Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Lin28bQ45KJ6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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