Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmub2Q3V209 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms