Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ulk4Q3V129 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms