Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms