Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms