Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV31

Rnf223, RING finger protein 223, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf223Q3UV31 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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