Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms