Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd27Q3UMR0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd27Q3UMR0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms