Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms