Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc58Q3UGP9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms