Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ttll12Q3UDE2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttll12Q3UDE2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttll12Q3UDE2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms