Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
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Gtpbp6Q3U6U5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Gtpbp6Q3U6U5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
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Gtpbp6Q3U6U5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Gtpbp6Q3U6U5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Gtpbp6Q3U6U5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Gtpbp6Q3U6U5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Gtpbp6Q3U6U5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp6Q3U6U5 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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