Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms