Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms