Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYD6

Lmtk2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, mousemouse

Predictions only

Length 1,471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk2Q3TYD6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lmtk2Q3TYD6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lmtk2Q3TYD6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms