Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms