Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fubp3Q3TIX6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fubp3Q3TIX6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms