Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms