Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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Shroom4Q1W617 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Shroom4Q1W617 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms