Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tdrd9Q14BI7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms