Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli2Q0VGT2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms