Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms