Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms