Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms