Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neurl1bQ0MW30 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms