Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms