Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms