Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelaQ04207 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelaQ04207 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelaQ04207 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms