Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnd1Q03719 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnd1Q03719 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnd1Q03719 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnd1Q03719 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnd1Q03719 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnd1Q03719 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnd1Q03719 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnd1Q03719 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnd1Q03719 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnd1Q03719 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnd1Q03719 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnd1Q03719 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnd1Q03719 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnd1Q03719 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnd1Q03719 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnd1Q03719 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnd1Q03719 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnd1Q03719 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms