Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms