Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms