Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms