Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms