Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VcpQ01853 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms