Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms