Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms