Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms