Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms