Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csf2raQ00941 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms