Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms