Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VldlrP98156 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms