Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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