Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Otx1P80205 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Otx1P80205 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms