Protein–RNA interactions for Protein: P70408

Cdh10, Cadherin-10, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh10P70408 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh10P70408 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh10P70408 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh10P70408 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh10P70408 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh10P70408 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh10P70408 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh10P70408 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh10P70408 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh10P70408 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh10P70408 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh10P70408 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh10P70408 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh10P70408 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh10P70408 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh10P70408 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh10P70408 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh10P70408 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh10P70408 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh10P70408 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh10P70408 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh10P70408 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh10P70408 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh10P70408 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh10P70408 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh10P70408 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh10P70408 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh10P70408 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh10P70408 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh10P70408 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh10P70408 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh10P70408 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh10P70408 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh10P70408 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh10P70408 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdh10P70408 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh10P70408 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh10P70408 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh10P70408 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh10P70408 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh10P70408 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh10P70408 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh10P70408 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh10P70408 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh10P70408 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh10P70408 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh10P70408 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh10P70408 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh10P70408 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh10P70408 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh10P70408 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdh10P70408 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh10P70408 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh10P70408 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh10P70408 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdh10P70408 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh10P70408 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh10P70408 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh10P70408 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh10P70408 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdh10P70408 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh10P70408 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh10P70408 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh10P70408 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh10P70408 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh10P70408 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh10P70408 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh10P70408 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh10P70408 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh10P70408 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh10P70408 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh10P70408 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh10P70408 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh10P70408 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh10P70408 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh10P70408 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh10P70408 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh10P70408 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms