Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms