Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms