Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms