Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfixP70257 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfixP70257 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfixP70257 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfixP70257 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NfixP70257 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NfixP70257 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfixP70257 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfixP70257 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfixP70257 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NfixP70257 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NfixP70257 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfixP70257 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NfixP70257 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NfixP70257 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfixP70257 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NfixP70257 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfixP70257 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfixP70257 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfixP70257 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfixP70257 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfixP70257 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfixP70257 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfixP70257 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfixP70257 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfixP70257 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NfixP70257 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfixP70257 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfixP70257 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfixP70257 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NfixP70257 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfixP70257 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfixP70257 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfixP70257 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfixP70257 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfixP70257 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfixP70257 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfixP70257 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfixP70257 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfixP70257 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfixP70257 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NfixP70257 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NfixP70257 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NfixP70257 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NfixP70257 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NfixP70257 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NfixP70257 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
NfixP70257 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NfixP70257 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NfixP70257 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NfixP70257 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NfixP70257 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfixP70257 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NfixP70257 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfixP70257 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfixP70257 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfixP70257 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfixP70257 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfixP70257 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfixP70257 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfixP70257 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfixP70257 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfixP70257 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfixP70257 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfixP70257 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfixP70257 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfixP70257 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NfixP70257 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfixP70257 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfixP70257 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfixP70257 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfixP70257 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfixP70257 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfixP70257 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfixP70257 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfixP70257 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfixP70257 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfixP70257 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfixP70257 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfixP70257 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfixP70257 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfixP70257 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfixP70257 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NfixP70257 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfixP70257 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfixP70257 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfixP70257 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfixP70257 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfixP70257 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfixP70257 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfixP70257 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfixP70257 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfixP70257 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NfixP70257 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfixP70257 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfixP70257 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NfixP70257 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfixP70257 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfixP70257 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NfixP70257 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms