Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc9P70170 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc9P70170 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms